Программа для анализа стволовых клеток

Специалисты Института науки о стволовых клетках Аллена (США) разработали веб-приложение Allen Integrated Cell, которое позволяет моделировать сложные детали человеческих индуцированных плюрипотентных стволовых клеток*. В частности, этот программный продукт обеспечивает трехмерное представление этих клеток в их плюрипотентном состоянии, включая визуализацию различных молекулярных элементов и важных структур (органоидов), которые выполняют уникальные функции внутри клеток.

Эти интегрированные структуры управляют основными функциями клетки, и модели, визуализируемые в Allen Integrated Cell, предоставляют основу для моделирования различных типов клетки, заболеваний, реакций на лекарства и клеточную среду.

Allen Integrated Cell объединяет в себе две технологии, улучшающие наше понимание того, как человеческие индуцированные плюрипотентные стволовые клетки различаются по своей форме и организации. Система включает в себя детерминированную модель, которая отображает клеточную анатомию в отдельных клетках, и вероятностную модель, которая показывает анатомию, которую, как считает алгоритм, эта клетка будет иметь, причем даже для клеток, которые не были должным образом еще не исследовались и не анализировались.

Новое приложение использует данные, полученные при исследовании большой коллекции живых человеческих клеток, которое проводили ученые института Аллена. Они внедряли флуоресцентные белковые метки в клетки, которые позволяли высветить специфические структуры внутри клеток, такие как ядро и митохондрия. Ученые сфотографировали десятки тысяч этих светящихся клеток и использовали искусственный интеллект для их изучения.

Доступ к программе бесплатный и ученые со всего мира могут воспользоваться этой новейшей разработкой здесь.

* Индуцированные плюрипотентные стволовые клетки — это взрослые стволовые клетки, генетически изменённые и полученные в лаборатории. Они имеют свойства эмбриональных стволовых клеток. Несмотря на то, что такие клетки ведут себя и экспрессируют те же гены, которые обычно экспрессируются в нормальных эмбриональных стволовых клетках, они не являются их полным подобием.